نقش اثرات ايمپرينتينگ در برآورد واريانس اثرات با منبع والدي براي صفات رشد در گوسفند زندي

Role of imprinting effects on e stimation of variance due to parent of origin effects for growth traits in Zandi sheep

در اين تحقيق واريانس با منبع والدي براي صفات رشد در گوسفند زندي با استفاده از ماتريس روابط گامتي برآورد شد. داده هاي مورد استفاده در اين تحقيق از 9562 راس گوسفند طي سال هاي 1370 تا 1390 از ايستگاه تحقيقاتي گوسفند زندي (ايستگاه خجير) كه تحت نظارت مركز اصلاح نژاد دام كشور مي باشد، جمع آوري شد. صفات مورد مطالعه شامل وزن تولد، وزن شيرگيري، وزن شش ماهگي، وزن 9 ماهگي و وزن يك سالگي بود. اجزاي (كو)واريانس صفات توسط نرم افزار WOMBAT و روش الگوريتم ميانگين اطلاعات بيش ترين درست نمايي محدود شده برآورد شد. به منظور برآورد ميزان واريانس ايمپرينتينگ از يك روش دو مرحله اي استفاده شد. در مرحله اول مدل بهينه با استفاده از معيار AIC انتخاب و در مرحله دوم اثرات ايمپرينتينگ پدري و مادري به مدل انتخابي اضافه و ميزان واريانس با منبع والدي برآورد شد. در تمام صفات مورد مطالعه افزودن اثرات ايمپرينتينگ موجب بهبود برازش مدل شد. دامنه برآورد واريانس با منشا والدي براي صفات مختلف از شش تا هشت درصد واريانس كل براي ايمپرينت پدري به ترتيب براي صفات وزن شيرگيري و وزن 9 ماهگي، و از هفت تا 15 درصد واريانس كل براي ايمپرينتينگ مادري به ترتيب براي وزن يك سالگي و وزن تولد برآورد شد. افزودن اثرات ايمپرينتينگ به مدل باعث كاهش برآورد واريانس هاي ژنتيكي مادري و ژنتيكي افزايشي شد. در اين تحقيق نشان داده شد كه افزودن اثرات ايمپرينتينگ مي تواند در بهبود برآورد مدل براي صفات رشد در گوسفند موثر باشد.

In this study parent of origin effects for growth traits in Zandi sheep was estimated using gametic relationship matrix. Data was collected from the Khojir Breeding Station of Zandi sheep, using 9562 sheep between 1991 and 2011. The traits such as birth, weaning, 6-month, 9-month and yearling weights were studied. (Co) variance components were estimated by WOMBAT software through Average Information REML algorithm (AI-REML). To estimate imprinting variances, a two steps method was used. In the first step, the best model was selected according to the lowest AIC, then in the second step paternal and/or maternal imprinting effects were added to the selected models. In all traits, adding imprinting effects in the models had beneficial effects on our estimates. Paternal imprinting effects ranged from 6-8 presents for weaning and 9-month weights, respectively of total phenotypic variance. Maternal imprinting effects ranged from 7-15 presents for yearling and birth weights, respectively. Adding imprinting effects in models reduced the heritability and maternal genetic. Adding parent of origin (imprinting) effect in models could have beneficial effects for analyses of body weight traits in sheep.