شناسايي و بررسي گوناگوني ژنتيكي باكتري هاي اسيد لاكتيك باكتري هاي اسيد لاكتيك غير آغازگر در پنير رسيده تالشي

Identification and Genotypic Characterization of Non-Starter Lactic Acid Bacteria in Mature Taleshi Cheese

سابقه و هدف: امروزه روش هاي مولكولي بر پايه PCR در مطالعه گوناگوني ميكروبي غذاهاي تخميري به طور گسترده اي كاربرد يافته اند. هدف اين مطالعه شناسايي و بررسي گوناگوني ژنتيكي باكتري هاي اسيدلاكتيك جدا شده از پنير سنتي تالشي است. مواد و روش ها: 54 سويه وحشي باكتري اسيد لاكتيك در محيط هاي M17 وMRS ايزوله شده و پس از استخراج DNA با روش RAPD-PCR و نرم افزار MVSP خوشه بندي شدند. گونه ها توسط آزمونS rRNA 16 شناسايي شدند. يافته ها: شش بيوتايپ اصلي و غالب در اين پنير سنتي شامل جنس ها و گونه هاي لاكتوباسيلوس پاراپلانتاروم، پلانتاروم، ساكئي، پاراكازئي و لاكتوكوكسي ها، گونه هاي استرپتوكوكوس گالوليتيكوس، انتروكوكوس فكاليس و فيسيوم بودند. بحث: پرايمر هاي به كار گرفته شده M13 و D836 در روش RAPD-PCR قادر به ايجاد پروفايل ها باندي مجزايي بوده كه امكان تفكيك و خوشه بندي جدايه ها را فراهم ساخت. وجود 26 ژنوتايپ در ميان 54 جدايه نشان دهنده گوناگوني ژنتيكي بالايي بود. نتيجه گيري: روش هاي مولكولي قادر به تفكيك و شناسايي سريع و قابل اطمينان باكتري هاي اسيد لاكتيك بوده و گوناگوني ژنتيكي بالايي آنها را نيز نشان دادند. غالب ترين باكتري غير آغازگر را نيز لاكتوباسيلوس هاي هترو فرمانتاتيو تشكيل مي دادند.

Background: The development of molecular methods such as RAPD-PCR and 16SrRNA sequencing has facilitated the identification and evaluation of microbial diversity of complex microbial environment like fermented food. The aim of this study is identifying and genotyping of different lactic acid bacteria genius and species involved in maturation of traditional Taleshi Cheese. Methods: About 54 wild isolates on MRS and M17 mediums were selected and analyzed by culture dependent RAPD-PCR technique. Gel patterns derived by randomly designed M13 and D8635 primers clustered based on Pearson product moment correlation coefficient and UPGMA via MVSP software. 16SrRNA sequencing has been used for species identification. Results The results revealed dominate non-starter lactic acid bacteria among isolates belonged to Lactobacillus genus including paraplantarum، curvatus، Sakei، paracase species following by Streptococcus gallolyticus and Enterococcus faecalis/Enterococcus faecium. Conclusion: The results showed that RAPD-PCR and 16SrRNA sequencing were useful and rapid tools for grouping، strain discrimination and identification of lactic acid bacteria. Also، obtained 26 different genotypes represented a wide genetic diversity in this type of traditional cheese