تعيين ترادف ژن پروتئين پوششي دو جدايه ايراني ويروس موزائيك هندوانه و بررسي جايگاه فيلوژنتيكي آنها

Nucleotide Sequence and Phylogenetic Analysis of Coat Protein Gene of Two Iranian Watermelon Mosaic Virus Isolates

ويروس موزاييك هندوانه WMV) Watermelon mosaic virus) متعلق به جنس Potyvirus و خانواده Potyviridae از ويروسهاي مهم آلوده كننده كدوئيان در دنيا محسوب مي­ شود. دو جدايه اين ويروس به نامهاي YAZ.WMV.41 و YAZ.WMV.55 از مزارع خيار و طالبي استان يزد جمعآوري گرديد. آلودگي نمونهها با آزمون سرولوژيكي الايزاي مستقيم و غيرمستقيم و آنتي بادي پلي‌كلونال اين ويروس بررسي شد. اين دو جدايه در مقابل آنتيبادي واكنش نشان ندادند. در بررسي علائم اين جدايهها برروي گياهان آزمون كدوي مراغه، لوبيا چيتي و لوبيا چشم بلبلي، علائم متفاوتي با آنچه تا كنون در مورد جدايههاي اين ويروس گزارش شده، مشاهده گرديد. با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي قطعه ­اي به طول 809 جفت باز از ژن پروتئين پوششي تكثير و تعيين ترادف شد. مقايسه­ ي ترادف‌هاي بدست آمده در اين تحقيق با ترادف‌هاي موجود در بانك جهاني ژن نشان داد كه جدايههاي مورد مطالعه به همراه يك جدايه ­ي ايراني (رس شمار EU667627) با دامنه­ ي ميزباني متفاوت، در زير گروه IIB قرار ميگيرند. ساير جدايههاي ايراني گزارش شده قبلي در گروههاي I و AII قرار گرفتند. مقايسه­ ي ميزان تشابه اسيد نوكلئيك اين جدايهها با يكديگر نشان داد كه جدايههاي ايراني مربوط به اين مطالعه بيشترين و كمترين ميزان شباهت را با جدايههاي كشورهاي اسپانيا (رس شمار AJ579518) و ايران (رس شمار GQ421161) به ترتيب به ميزان 99/5 و 92/2 درصد دارا مي‌باشند. نتايج حاصل از اين تحقيق بيانگر اين است كه كدوئيان در مزارع وگلخانههاي ايران بوسيله جدايههاي متعدد اين ويروس آلوده مي شوند.

Watermelon mosaic virus (WMV) is a member of the genus Potyvirus in the family Potyiviridae. This virus is one of the most common and widespread viruses infecting cucurbits worldwide. In this research, partial biological and molecular characteristics of two WMV strains includingYAZ.WMV.41 and YAZ.WMV.55 collected from cucurbit growing farms in Yazd province were studied. These isolates did not react to polyclonal WMV antiserum in Direct and Indirect ELISA tests. Also, compared to several reported WMV isolates, these isolates induced different symptoms on the test plants. Coat protein (CP) gene (809 bp length) of these isolates was amplified in PCR, cloned and sequenced. Phylogenetic analysis showed that two Iranian and one previously reported WMV isolates (EU667626) are classified in subgroup IIB. Other Iranian isolates from the previous studies were clustered into sub groups I, IIA. Nucleotide sequence comparison indicated that these isolates share minimum and maximum nucleotide sequence identities (92.2 and 99.5 %) with a Spain (Accession no. AJ579518) and an Iranian (GQ421161) isolates, respectively. According to the results of this study, cucurbits are infected by different WMV isolates in Iran.