تايپينگ مولكولي سويه هاي اسينتو باكتر باماني جدا شده از عفونت هاي خون با روش ترادف يابي چند جايگاهي(MLST)

(Molecular typing of the Acinetobacter baumannii strains isolated from blood infections using Multi Locus Sequence Typing (MLST

سابقه و هدف: اسينتوباكتر باماني يك كوكوباسيل گرم منفي است كه در طبيعت انتشار وسيعي داشته و به عنوان يكي از عوامل مهم عفونت هاي بيمارستاني محسوب مي شود. مطالعه حاضر با هدف تعيين الگوي ژنتيكي جدايه هاي اسينتوباكتر باماني جدا شده از عفونت هاي خون به روش تايپينگ ترادف يابي چند جايگاهي (MLST) انجام شد. مواد و روش ها: در اين مطالعه مقطعي، تعداد 36 جدايه اسينتوباكتر باماني از عفونت هاي خوني بيماران بيمارستان هاي پيامبران و بقيه اله (عج) در تهران جداسازي شدند. سپس محصول PCR مربوط به تكثير 7 ژن خانه دار توالي يابي گرديد. توالي هاي نوكلئوتيدي تعيين شده از هر ژن در هر جدايه در بانك اطلاعاتي MLST آناليز و علاوه بر تعيين آلل هاي هر ژن، كلون هاي مربوط به تمامي جدايه ها تعيين گرديد. يافته ها: در مجموع 5 كلون ST25، ST136، ST307، ST327 و ST328 در 36 جدايه شناخته شد. ST مربوط به دو جدايه با اطلاعات مربوط در سايت MLST شناسايي نگرديد. ST هاي تعيين شده در 5 خوشه ژنتيكي A تا E قرار گرفتند. نتيجه گيري: شناسايي ميزان قابل قبولي از توع ژ«تيكي در بين جدايه ها با استفاده از تكنيك MLST نشان مي دهد كه اين روش در مطالعه و تايپينگ جدايه هاي اسينتوباكتر باماني روش مفيدي به حساب مي آيد. بنابراين، مي توان جدايه هاي با منشاء متفاوت را در گروه هاي مختلف تقسيم بندي نمود.

Background & Objectives: Acinetobacter baumannii is a Gram-negative coccobacillus that is widely distributed in nature and considered as one of the important causes of hospital infections. The present study was conducted to genotype Acinetobacter baumannii strains isolated from blood infections using Multi Locus Sequence Typing (MLST) method. Materials & Methods: A total of 36 Acinetobacter baumannii strains were isolated from blood infection samples collected from Baqiatalah and Payambaran hospitals، Tehran، Iran. The PCR products obtained from amplification of seven housekeeping genes were sequenced. The nucleotide sequences of each gene in each isolate were queried against the reference sequence in the MLST database. In addition to characterization of the alleles specific to each gene، the sequence types (ST) of all isolates were determined. Results: A total of 5 clones including ST25، ST136، ST307، ST327، and ST328 were identified in 36 isolates. ST of 2 isolates were not identified in MLST database. The identified STs were placed into 5 genetic clusters including A، B، C، D، and E. Conclusion: Identifying an acceptable level of genetic diversity among the isolates using MLST technique shows that this method is useful for studying and typing of Acinetobacter baumannii isolates. Therefore، it is possible to cluster isolates with diverse origins in different groups.