تنوع ژنتيكي جدايه هاي Fusarium oxysporum f. sp. ciceri عامل پژمردگي نخود در استان كرمانشاه با استفاده از نشانگرهاي ريزماهواره

Genetic diversity of F. oxysporium f. sp. ciceri isolates causal agent of wilt chickpea in Kermanshah province using microsatellite markers

بيماري پژمردگي يكي از مهم ترين بيماري هاي نخود در استان كرمانشاه است كه توسط قارچ Foc) Fusarium oxysporum f. sp. ciceri) ايجاد مي شود. براي تعيين تنوع ژنتيكي در جمعيت هاي قارچ Foc از گياهان آلوده نخود در مزارع مختلف استان كرمانشاه شامل اسلام آباد، سرپل ذهاب، درود فرامان، ماهي دشت و هرسين كه علائم زردي و پژمردگي داشتند، به طور تصادفي نمونه برداري صورت گرفت. در نهايت 45 جدايه قارچ Focاز نمونه هاي آلوده با استفاده از محيط كشت سيب-زميني، دكستروز، آگار جداسازي شد. براي مطالعه ساختار ژنتيكي در جدايه ها از پنج جفت آغازگر ريزماهواره استفاده شد. همه آغازگرها 100 درصد چندشكلي نشان دادند و تعداد 15 آلل مختلف در بين همه جدايه ها مشخص شد. ميانگين ميزان محتواي اطلاعات چندشكلي نشانگر ها 91 درصد بود. براساس دندروگرام با روش الحاق مجاور، جدايه ها به نه گروه مختلف تقسيم شدند. مقايسه پارامترهاي مربوط به تنوع ژنتيكي از جمله ضريب شانون در جمعيت ها نشان داد كه جدايه هاي منطقه درودفرامان داراي بالاترين تنوع ژنتيكي مي باشند. كم ترين فاصله ژنتيكي بين جدايه هاي هرسين و درود فرامان مشاهده شد. تجزيه واريانس مولكولي نشان داد كه ميزان تنوع ژنتيكي در درون جمعيت ها 93 درصد و بين جمعيت ها هفت درصد مي باشد. نتايج به دست آمده از اين مطالعه مي تواند در اصلاح ارقام مقاوم و گسترش اقدامات قرنطينه اي بسيار مفيد باشد.

Wilt disease caused by Fusarium oxysporium f.sp. ciceri (Foc) is one of the most important diseases of chickpea in Kermanshah Provinces. For determining of genetic diversity in Foc populations، Chickpea plants with wilt and yellowing symptoms were randomly sampled from different farms such as: Islamabad، Sarpolezahab، Dorodfaraman، Mahidasht and Harsin. A total of 45 Foc isolates were obtained from infected samples by potato dextrose agar media (PDA). Five Simple sequence repeat (SSR) paired primers were used for study of genetic structure of isolates. (SSR) markers showed 100 polymorphic percent. A total of 15 alleles were revealed in Foc isolates. The average of polymorphic information content was 91% for all markers. Based on dendrogram with neighbor joining method، the isolates were divided into nine groups. A comparison of the parameter related to genetic diversity including Shannon's information index (I) of populations indicated that Drodfaraman have the highest genetic diversity. The smallest genetic distance was observed between Drodfaraman and Harsin. The AMOVA analysis of genetic variation in Foc populations revealed that 93% of the variance occurred within populations and 7% occurred among populations. Knowledge of genetic diversity in Foc provides different levels of information which is important in the management of germplasm resources. Results from this study will be useful in breeding for chickpea resistant cultivars and developing necessary quarantine regulations.