برآورد وراثت پذيري ژنومي صفات رشد در نسل F2 حاصل از تلاقي لاين آرين و مرغ بومي آذربايجان به كمك يك تراشهK 60

Estimation of genomic heritability for growth traits in an F2 crosses of Arian broiler line and Azerbaijan indigenous chicken using 60K SNP Beadchip

درك كنترل ژنتيكي صفات رشد يكي از مهم‌ترين اهداف اصلاح نژادي در پرورش طيور است. به‌منظور يافتن وراثت پذيري ژنومي صفات رشد، از تراشه تجاري SNP ژنوم مرغ در جمعيت F2 حاصل از تلاقي دوطرفه مرغ بومي آذربايجان و لاين B سويه گوشتي آرين استفاده گرديد. وراثت‌پذيري ژنومي با استفاده از روش آماري بهترين پيش بيني نااريب خطي ژنومي (GBLUP) براي صفات يك، سه، پنج، هفت و نه هفتگي وزن بدن و طول شانك برآورد گرديد. به‌ منظور بررسي ارتباط بين حداقل فراواني آللي SNP‌ ها (MAF) و ميزان وراثت‌پذيري برآورد شده براي صفت رشد هفت هفتگي، SNP ها به پنج گروه MAF تقسيم گرديد (0/1-0، 0/2-0/1، 0/3-0/2، 0/4-0/3، 0/5-0/4). همچنين براي برآورد وراثت‌پذيري ژنومي در هر گروه، پنج مدل مطابق با ماتريس روابط خويشاوندي ژنومي داخل هر گروه استفاده گرديد. وراثت‌پذيري ژنومي برآورد شده براي وزن‌هاي هفتگي از 0/43 در هفته اول تا 0/27 در هفته نهم و براي صفات هفتگي شانك از 0/46 در هفته اول تا 0/12 در هفته نهم برآورد گرديد. مقدار همبستگي ژنومي به‌دست‌آمده براي دو صفت در طي اين هفته‌ها نشان‌دهنده همبستگي ژنومي بالا براي اين دوصفت است. مقدار وراثت‌پذيري براي پنج گروه MAF به ترتيب 0/15، 0/30، 0/17، 0/26 و 0/27 به دست آمد. در اين تحقيق بيشترين مقدار وراثت‌پذيري برآورد شده مربوط به گروه فراواني 0/2-0/1 است. وراثت پذيري ژنومي يافت شده در اين تحقيق درك بهتري از كنترل ژنتيكي صفات رشد را نشان مي دهد. استفاده از اين يافته‌ها ميتواند باعث تسريع در پيشرفت ژنتيكي برنامه‌هاي اصلاح نژادي شود.

Understanding the genetic control of growth traits is one of the most important breeding goals in poultry breeding. In order to estimate the genomic heritability of growth traits, we used Illumnia 60K chicken SNP Beadchip in a chicken F2 resource population derived from the reciprocal cross between Arian line and Azerbaijan indigenous chicken. The genomic heritability was estimated through genomic relationship matrix for body weights and Shank lengths at different ages 1,3,5,7 and 9 weeks. To investigate the relationship between allele frequency and genomic heritability estimated for BW7 explained by markers, SNPs were classified into five groups of MAF (0 – 0.1, 0.1 – 0.2, 0.2 – 0.3, 0.3 – 0.4 and 0.4 – 0.5). To estimate the genomic heritability, five models were fitted accounting for the similarity relationship matrix within each of the five MAF groups, respectively. The genomic heritability estimations ranged from 0.43 to 0.27 for bw1 and bw9, and from 0.46 to 0.12 for Shl1 and Shl9, respectively. The estimated genomic correlations between BW and ShL at differen t ages were moderately high. Estimated heritabilities were 0.15, 0.3, 0.17, 0.26 and 0.27 for each of the five MAF groups, respectively. Interestingly, heritability estimates revealed highest value for MAF group (0. 1 to 0. 2). Genomic heritability estimat ed here can contribute to a better understanding of the genetic control of growth traits in broiler chickens. I n addition, using these findings can accelerate the genetic progress in the breeding programs.