ارزيابي تنوع ژنتيكي ژنوتيپ هاي چغندرقند مقاوم و حساس به نماتد سيستي Heterodera schachtii با استفاده از نشانگرهاي مولكولي SSR

Assessment of Genetic Diversity among Resistant and Susceptible Sugar Beet Genotypes to Cyst Nematod using SSR molecular markers

چغندر قند با نام علمي Beta vulgaris L. گياهي است دولپه و دوساله از خانواده اسفناجيان كه اهميت اقتصادي آن به دليل خاصيت منحصر به فرد آن در توليد مقادير بالاي قند مي باشد. نماتد سيستي چغندرقند مهم ترين بيماريهاي چغندر قند در اراضي تحت كشت اين محصول به شمار ميآيد. اين مطالعه به منظور ارزيابي تنوع ژنتيكي20 ژنوتيپ چغندرقند مقاوم و حساس به نماتد سيستي، با استفاده از نشانگر مولكولي SSR انجام گرديد. تكثير قطعات ژنومي با استفاده از 10 جفت آغازگر اختصاصي SSR انجام شد به طوري كه از بين باندهاي حاصل، 49 باند چندشكل از 7 جفت آغازگر منتخب به دست آمد. بيشترين محتواي اطلاعات چندشكلي و بيشترين مقدار شاخص نشانگر به ترتيب مربوط به جفت آغازگرهايREP و 10114 بدست آمد. در اين مطالعه بيشترين تشابه ژنتيكي بين دو ژنوتيپ متحمل و حساس به نماتد سيستي چغندرقند مشاهده شد. با توجه به نتايج به دست آمده مي توان استنباط كرد كه تنوع ژنتيكي ايجاد شده رابطه مستقيمي با مقاوم يا حساس بودن ژنوتيپها ندارد. در واقع مشخص گرديد كه ژنوتيپهاي چغندرقند از نظر ژنتيكي بر اساس طيفهاي مختلف مقاومت، حساسيت و متحمل بودن به بيماري نماتد سيستي در گروههاي مجزا قرار نگرفتند و همبستگي قابل توجهي را نشان ندادند.

Sugar beet (Beta vulgaris L.) is a dicotyledonous and two years plant from Chenopodiceae family and its economic importance is due to unique ability to produce high amounts of sugar. Sugar beet cyst nematode is the most important disease in the area under cultivation of this product. So this study was performed to assess the genetic diversity of 20 genotypes resistant and susceptible nematode using SSR markers. Following DNA extraction, PCR amplification was performed using 10 pairs of SSR primers and 49 polymorphic bands were selected from 7 pairs. The highest of Polymorphism Information Content (PIC) and highest Marker Index (MI) related to REP primer pairs and 10114 respectively. Cluster analysis using NTSYS software with UPGMA method based on Dice's similarity matrix divided genotypes into 4 clusters. The highest genetic similarity between tolerant and susceptible sugar beet cyst nematode was found. According to the results, it can be concluded that genetic variation does not have a direct relationship with resistant or sensitive genotypes. In fact, it was found that genotypes of sugar beet based resistance spectrum, sensitivity and tolerance to nematode disease were not in separate groups and a significant correlation was not observed.