رديابي سرولوژيكي و مولكولي ويروس موزاييك شلغم (TuMV) در علف هرز ناخنك (Goldbachia laevigata) در مزارع زعفران

Serological and Molecular Detections of Turnip Mosaic Virus on Goldbachia laevigata in Saffron Fields

ويروس موزاييك شلغم (Turnip mosaic virus; TuMV) از خانواده پوتي­ويريده و جنس پوتي­ويروس، داراي وسيع‌ترين دامنه ميزباني در بين ويروس­هاي اين جنس است. علف‌هاي هرز به عنوان منابع نگهدارنده ويروس نقش مهمي در همه‌گيري آن روي گياه اصلي دارند. به منظور رديابي و بررسي حضور TuMV، 44 گونه علف‌ هرز مربوط به هشت خانواده در بهار 1396 از مزارع زعفران شهرستان‌هاي قائن، فردوس، سرايان و بيرجند جمع‌آوري گرديد. رديابي اوليه ويروس در نمونه‌ها، با آزمون الايزا و RT-PCR با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي صورت گرفت و نمونه‌اي كه در الايزا و PCR مثبت بود، تعيين توالي گرديد. در بين 44 علف‌هرز، تنها نمونه مربوط به علف‌هرز ناخنك (Goldbachia laevigata) در آزمون الايزا مثبت بود كه در RT-PCR نيز قطعه‌اي به طول 864 جفت باز مربوط به توالي كامل پروتئين‌ پوششي تكثير نمود. در درخت تبارزايي حاصل از اين جدايه (KHo.IR) در مقايسه با 29 جدايه موجود در بانك جهاني ژن، چهار گروه تشكيل شد كه جدايه ايراني در گروه Basal BR قرار گرفت. بررسي يكساني نوكلئوتيدي اين جدايه با 29 جدايه بانك جهاني ژن، نشان داد كه بيشترين تشابه بين جدايه مورد مطالعه با جدايه ايتاليا (AB093600) به ميزبان 93/6 درصد و كمترين شباهت با جدايه‌اي از كانادا (D10927) برابر با 87/6 درصد مي‌باشد. بنابر نتايج، علف هرز ناخنك به عنوان گياه نگهدارنده TuMV در مزارع زعفران معرفي گرديد. تحقيق حاضر اولين بررسي سرولوژيكي و مولكولي TuMV در علف‌هاي‌ هرز مزارع زعفران در ايران مي‌باشد.

Turnip mosaic virus is a member of family Potyviridae, genus Potyvirus, have the widest host range in Potyviruses. Weeds are reservoir plants for viruses and have an important role in this epidemiology. In order to identify the wild hosts of TuMV in saffron fields, 44 samples were collected during April 2017 from Ghaen, Ferdows, Sarayan and Birjand cities of South Khorasan province. TuMV were detected by ELISA and RTPCR. Positive samples were sequenced and then analyzed by Phylogenetic software. Among 44 samples, Goldbachia laevigata was positive in ELISA and this isolate (KHo.IR) was amplified 864 bp of Coat protein gene using RT-PCR. In phylogenetic tree of KHo.IR and 29 isolates of gene bank, four groups were formed that KHo.IR was in Group Basal BR. Homology matrix of KHo.IR and 29 gene bank isolates showed that the closest gene bank isolate was from Italy with 93.6% homologies and the furthest isolate was from Canada with 87.6% homologies. According to the results, Goldbachia laevigata serves as a reservoir plant of TuMV in saffron fields. This is the first survey of TuMV on weeds of Iranian saffron fields.