ارزيابي تنوع ژنتيكي ژرم‌پلاسم خاكشير تلخ با استفاده از نشانگر ISSR

Evaluation of Genetic Diversity in Sisymbrium irio Germplasm Using ISSR Marker

گياه خاكشير تلخ، داراي خواص دارويي زيادي مي ­باشد. مديريت تنوع ژنتيكي و گياهان بومي از برنامه ­هاي حفاظتي ضروري و مهم هر كشوري است. در اين تحقيق، تنوع ژنتيكي 33 توده از خاكشير تلخ با نشانگر مولكوليInter Simple (Sequence Repeat (ISSR مورد بررسي قرار گرفت. در مجموع 183 مكان كروموزومي ارزيابي شده و در مجموع 1537 باند ايجاد شده و امتيازدهي شدند. 11 آغازگر ISSR مورد استفاده، 100درصد چند­شكلي را نشان دادند. ميانگين محتواي اطلاعات چند­شكلي PIC) 31/5) درصد به‌دست آمد. كمترين مقدار PIC براي آغازگر AG)8T) برابر با مقدار 24/5 درصد و بيشترين مقدار هم براي آغازگر GGGC(GA)8 با مقدار 38/5 بود. حداكثر شاخص نشانگري در آغازگر AG)8YT) برابر با مقدار 6/93 بود بنابراين به‌عنوان آغازگر برتر براي مطالعات بعدي روي انواع خاكشير معرفي مي­شود. الگوي كلي از توزيع تنوع مولكولي براي نشانگرها نشان داد كه 17 درصد تنوع مربوط به بين گونه‌ها و 83 درصد تنوع مربوط به درون گونه­ ها مي‌باشد. به‌طوركلي مي‌توان گفت كه تنوع ژنتيكي درون گروه ­ها و گروه ­بندي كردن نمونه ­ها در نقطه برش، با فاصله جغرافيايي كه بين استان‌­هاي مورد مطالعه وجود دارد، هم­خواني دقيقي ندارد. ازجمله دلايل اين پديده مي‌تواند انتقال ژرم­ پلاسم‌ها بين اين مكان‌ها و يا اختلاط بذور يا جريان ژني بين جمعيت‌ها در هنگام برداشت براي مصارف خوراكي و دارويي و خاستگاه مشترك نمونه‌ها باشد.

Sisymbrium irio or bitter flixweed is important among the medicinal plants. The human population overgrowth and absence of a comprehensive management of natural resources caused a fast decrease in most valuable indigenous germplasm. Management of genetic diversity of native plants is important in conservation programs. Using molecular techniques, especially ISSR, one can study genetic diversity and analyze the genetic variation. In this study the genetic diversity of 33 populations of S. irio has been investigated by Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) marker. In total, 183 sites were investigated. 11 ISSR primers in this study showed 100% polymorphism. The average polymorphism information content (PIC) was equal to 31.5. The minimum amount of PIC for primer (AG) 8T was equal to 24.5 and maximum amount of PIC for primer GGGC (GA) 8 was equal to 038/5. The maximum amount of MI for primer (AG) 8YT was equal to 21.82, therefore it is the most proper primer for further studies. Results showed high variation among and between genotypes and there is the chance of selection and modification.