پيش بيني اثر گذاري miR-146, miR-142 و miR-150 در تمايز سلول هاي +naive CD4 به سلول هاي Th17 در بيماري مولتيپل اسكلروزيس

Bioinformatics methods shows the probability of miR-142, miR-146 & miR-150’s role in differentiation of naïve cd4+ to Th17 cells in multiple sclerosis

زمينه و هدف: miRNAها دسته اي از RNA هاي غير كدشونده هستند كه در فرايندهاي مختلف سلولي ايفاي نقش مي كنند. اخيراً تغيير بيان اين مولكول ها در بيماري هاي بسياري گزارش شده است. متأسفانه بيماري مالتيپل اسكلروزيس امروزه به عنوان يك بيماري خود ايمن در ايران رو به افزايش است. سلول هاي Th17 مهم ترين سلول ها در اين بيماري مي باشند. در اين مطالعه ما به دنبال نقش احتمالي miRNA هاي miR-142، miR-146a و miR-150 در روند تمايز سلول هاي TH17 بوديم كه بدين واسطه مي توانند در شروع و روند بيماري MS اثر گذار باشند. روش بررسي: با استفاده از پايگاه داده ي miRwalk كه به عنوان يك پايگاه داده جامع كه از 10 الگوريتم براي پيش بيني بر هم كنش هاي miRNA-mRNA استفاده مي كند، بر هم كنش هاي محتمل miRNA هايي كه در بيمارهاي خود ايمن دچار تغيير بيان مي شدند را با ژن هايي كه تمايز سلول هاي TH17 را كنترل مي كنند را بررسي كرديم. يافته ها: بر اساس پيش بيني صورت گرفته احتمال مي رود miR-142، miR-146a و miR-150 با القاي تمايز به سمت سلول هاي Th17 عامل پاتوژنز بيماري مالتيپل اسكلروزيس باشند؛ بنابراين با مهار اين miRNAs امكان كاهش علائم اين بيماري وجود دارد. نتيجه گيري: در نهايت انتظار مي رود miR-142، miR-146a و miR-150 در سلول هاي Th17 بيماران مبتلا به MS افزايش بيان داشته باشند، چرا كه مطالعات داده شناسي زيستي نشان دهنده ي مهار تنظيم كننده هاي منفي تمايز Th17 توسط اين 3 miRNA مي باشند. در نتيجه مي توان چندين راه درماني با استفاده از اين miRNA ها در نظر گرفت، علاوه بر اين مي توانند شاخص هاي بيولوژيك مناسبي براي پيش بيني و تشخيص مراحل مختلف بيماري باشند.

Background and aims: MiRNAs are a class of non-coding RNAs that take part in various cellular processes. Recently dysregulation of these small molecules reported in numerous disorders. Unfortunately prevalence of Multiple sclerosis (MS) as an autoimmune disease is rising nowadays in Iran. Th17 cells are the most important cell in this disease. In this study, we have predicted possible role of 3 miRNAs, miR142, miR-146a and miR-150 which could control Th17 differentiation. So, possibly it influences on MS onset and progress. Methods: Using miRwalk database as an integrative database which utilizes 10 different algorithms to predict miRNA-mRNA interaction, it was investigated probable interaction of miRNAs and genes that participate in Th17 differentiation. Results: Based on this study, 3 distinct miRNAs, miR-142, miR-146a and miR-150, were predicted to have a potential role in induction of Th17 differentiation. Therefore, control of these miRNAs could reduce MS symptoms. Conclusion: Conclusively, miR-142, miR-146a and miR-150 may be up-regulated in Th17 of MS patients, since bioinformatics data have shown that these miRNAs suppress negative regulator genes in Th17 differentiation. Thus, several therapeutic approaches may be considered for these miRNAs besides of their application as the valuable prognostic/diagnostic biomarkers in detection of various stages of MS.